Контрольно-счетная палата создана в соответствии с Уставом Новосибирской области (ст.108) и законом Новосибирской области «О Контрольно-счетной палате Новосибирской области», принятым на 7-й сессии областного Совета второго созыва 27 октября 1998г. Структура и штатная численность Контрольно-счетной палаты были утверждены решением 9-й сессии от 25 ноября 1998г., согласно которому кроме председателя палаты предусматривалось, один заместитель председателя, четыре аудитора, шесть инспекторов, делопроизводитель и бухгалтер. Всего 14 человек. Решением 21 сессии от 2 ноября 1999г. назначен первый председатель Контрольно-счетной палаты Новосибирской области Шилин Юрий Иванович. Поэтому именно 2 ноября 1999 года является отправной точкой, датой с которой начались формирование и деятельность Контрольно-счетной палаты Новосибирской области. В рамках объявленного конкурса, Юрием Ивановичем Шилиным, уже как председателем палаты, была проведена определенная работа по подбору кандидатур для участия в конкурсе на должность аудиторов. Из 35 претендентов на 22 сессии областного Совета 2 декабря 1999г. было избрано пять аудиторов: Тамара Петровна Лазарева, Валерий Николаевич Алехин, Лариса Анатольевна Федулова, Сергей Петрович Колпаков, Владимир Васильевич Ларин. В январе 25 сессией областного Совета депутатов по представлению аудиторов на должность заместителя председателя палаты назначается аудитор Лазарева Тамара Петровна. Формирование аппарата Контрольно-счетной палаты Новосибирской области осуществлялось в декабре 1999 года и в январе 2000 года. В декабре 1999 года для планирования и организации деятельности палаты, выработки методологии контрольно-ревизионной и аналитической деятельности, утверждение актов контрольных мероприятий и решения других важнейших вопросов была образована Коллегия палаты, в состав которой вошли председатель, заместитель председателя и аудиторы палаты. В заседаниях Коллегии часто принимают участие депутаты областного Совета, представители администрации Новосибирской области, руководители проверяемых организаций. После перехода аудиторов С.П. Колпакова и В.В.Ларина на другую работу, на вакантные должности были избраны 29 сессией областного Совета 31 мая 2000г. аудитор Галина Ивановна Бутакова и 35 сессией 29 ноября 2000г. аудитор Юрий Николаевич Цыркунов. Первый год работы палаты показал необходимость увеличения штатной численности палаты и усиления юридического сопровождения контрольных мероприятий. И решением 34 сессии областного Совета 1 ноября 2000г. утверждается новая структура и штатная численность Контрольно-счетной палаты Новосибирской области в количестве 23 человек, вводится должность второго заместителя председателя по юридическому обеспечению, а решением 38 сессии областного Совета 21.03.2001 года на эту должность по конкурсу избирается Гончарова Елена Анатольевна. Решением 10 сессии областного Совета депутатов третьего созыва от 3 октября 2002 года штатная численность палаты увеличивается до 28 человек, что позволило создать экспертно-аналитическое направление и усилить проведение предварительного контроля путем подготовки экспертизы проектов областного бюджета, целевых программ и финансовой экспертизы законопроектов, регулирующих бюджетные отношения. В ноябре 2004 года палата отметила свой первый юбилей – 5 лет с момента ее образования. Истекшее пятилетие в деятельности палаты прошло под знаком формирования и становления коллектива, наработки опыта, укрепления ее позиций и утверждения, как органа государственного финансового контроля, деятельность которого направлена в конечном итоге на повышение уровня жизни населения области. Результаты подтвердили правоту и своевременность принятого депутатами решения о создании палаты. За пять лет практической деятельности Контрольно-счетной палаты Новосибирской области в рамках предварительного, текущего и последующего контроля аудиторами и специалистами КСП было проведено 105 контрольных мероприятий, в результате которых установлено финансовых нарушений в использовании бюджетных средств и управлении государственным имуществом, подлежащих возмещению в бюджет области на сумму более двух миллиардов рублей. Из них, совместными действиями с администрацией области, субъектами контрольных мероприятий, при активной позиции депутатов областного Совета, возвращено и восстановлено средств в бюджет области более миллиарда рублей. Следует отметить, что за пять лет, на каждый вложенный в Контрольно-счетную палату Новосибирской области рубль в областной бюджет возвращено более 40 рублей. Об эффективности работы коллектива за этот период свидетельствуют показатели средней суммы выявленных финансовых нарушений и средней суммы возмещенных бюджетных средств, приходящихся на одно контрольное мероприятие, которые составили 93,8 млн.руб. и 10,2 млн.руб. соответственно. В этом же 2004 году, в ноябре, уходит со своего поста первый председатель Контрольно-счетной палаты Новосибирской области Юрий Иванович Шилин. Достойным приемником Шилина Ю.И. на этом посту стала его заместитель по юридическому обеспечению Е.А.Гончарова. Постановлением 34 сессии областного Совета депутатов третьего созыва 28 ноября 2004 года она была назначена на должность председателя палаты. Постановлением 48 сессии областного Совета депутатов Новосибирской области третьего созыва 1 декабря 2005 года установлена предельная штатная численность КСП в количестве 33 человека. В палату пришли высококвалифицированные специалисты из УФНС по Новосибирской области Колесников Валерий Николаевич и из коллегии адвокатов - Рягузов Денис Евгеньевич. Они прошли конкурсный отбор и были избраны на соответствующие должности заместителя председателя палаты. Все сотрудники палаты имеют высшее образование, как правило, экономическое и юридическое. В настоящее время в палате работает 40 человек, включая: председателя палаты, заместителя председателя палаты, четырёх аудиторов и аппарат палаты. Контрольно-счетная палата Новосибирской области является постоянно действующим органом внешнего государственного финансового контроля Новосибирской области. Палата образуется Законодательным Собранием Новосибирской области и подотчетна ему. Палата обладает организационной и функциональной независимостью и осуществляет свою деятельность самостоятельно.